郑州植物园内东区有银杏园、松柏园、木兰园、牡丹芍药园、竹园等15个专类园，以植物品种的收集与展示为主;在西区，有岩石园、盆景园、水生湿生植物观赏园、攀缘蔓趣园等10个专题园，以植物科学应用为主，体现"寓教于乐"。此外，植物园拥有"花海迎宾"、"象湖揽璧"、"天香咏华"、"予山飞霞"、"松畔溪照"、"花漫如歌"、"竹影石韵"、"山水灵秀"等八个景区共30余个景点。
除了专类园外，主题园设有园艺保健园、盲人植物园、能源植物园、五行保健园、SPA五官花园、儿童探索园等10个特色园区供市民游玩。
五行保健园，该园的植物规划以"五行学说"为基础，将阴阳理论对应人体的五脏，根据植物的不同药效，有方位、有系统地合理配置，突出生态性、保健性、美观性，形成对人体有益的休养氛围。例如，五行植物区之"金"，对应润"肺"益气，种植保健植物银杏、南天竹等;五行植物区之"木"，对应保"肝"降压，种植保健植物乌桕、飞木蓟等。
SPA五官花园引入保健养生概念，在庭中种植各类芳香植物:薰衣草、迷迭香、薄荷等。通过人体的五大感官功能，结合音乐、天然香薰植物、色彩与自然景观、花草茶、按摩呵护起到舒压减躁的疗效。
儿童探索花园为儿童提供一个游戏场地，包含趣味森林、生态游戏区、园艺作坊、奇幻花园、森林剧场。园中将展出能捉虫子的捕虫草、猪笼草等趣味性植物，引发儿童探索自然的好奇心。园中还有一些"害羞"的含羞草，怕"痒痒"的紫薇、花色会随土壤酸碱性变化的八仙花等。
